發(fā)布時間:2017-09-28來源:供稿:干細胞所 鄭輝 科教處 黃洲萍
DNA甲基化尤其是胞嘧啶的甲基化是最重要的表觀遺傳學(xué)修飾之一,多項生物學(xué)過程均涉及DNA甲基化水平的調(diào)控。近日,中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院鄭輝課題組通過研究細胞增殖過程中DNA甲基化(胞嘧啶的甲基化)的調(diào)控,發(fā)現(xiàn)DNA被動去甲基化的新作用。相關(guān)研究成果于2017年9月18日在線發(fā)表于Journal of Biological Chemistry上。
TET家族蛋白介導(dǎo)的DNA去甲基化被認為是主動去甲基化。另一方面,DNA在復(fù)制的過程中新合成的子鏈?zhǔn)菦]有DNA甲基化的,需要由DNMT1在細胞周期的S期完成DNA 甲基化從母鏈到子鏈的遺傳。這一甲基化遺傳過程一般可以保證DNA甲基化在細胞增殖過程的穩(wěn)定遺傳。但是,如果這一過程受到阻礙,DNA甲基化水平會有明顯降低,導(dǎo)致DNA的被動去甲基化。
鄭輝課題組在研究中發(fā)現(xiàn),細胞增殖過程中的DNA的甲基化遺傳雖然主要是由DNMT1在細胞周期S期完成的。但是DNMT1在S期的工作并不完善,仍然需要其繼續(xù)在細胞周期的G2/M期以及G1期完成。這一需求在細胞增殖加快或者DNMT1表達受到抑制時更加明顯。這樣的情況就導(dǎo)致細胞的整體DNA甲基化水平在G1期明顯高于G2/M期。進一步的全基因組甲基化測序表明,這樣的差距更多地集中在一些在多能干細胞特異性高表達的基因上。因此,當(dāng)被動組DNA去甲基化發(fā)生時,這些基因會發(fā)生更強的去甲基化。研究團隊通過進一步研究發(fā)現(xiàn):促進細胞增殖或者抑制DNMT1表達,可以有效誘導(dǎo)被動DNA去甲基化,誘導(dǎo)一些多能性基因(Oct4,Nanog等)發(fā)生更強的去甲基化,從而進一步促進體細胞重編程。
課題組的前期研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)體細胞重編程效率與細胞周期發(fā)生的次數(shù)而不是重編程的時間呈正相關(guān)。而該研究提示其中機制可能是:重編程過程中的每一次細胞周期都相當(dāng)于在一些多能性基因上誘導(dǎo)去甲基化。
該研究受到國家自然科學(xué)基金以及廣東省自然科學(xué)基金的支持。
細胞在G1期中的DNA甲基化水平比在G2/M期中的高。被動的DNA去甲基化則進一步加大此類差距,進而調(diào)控下游通路。
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