l? 2018-至今??? ?中科院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院 研究員
l? 2016-2018?? ??UCB制藥/資深研究員
l? 2013-2016?? ??弗朗西斯克里克研究所/博士后 ?????
????????????????合作導師：John Diffley FRS? 英國皇家學會院士
l? 2012-2013?? ??癌癥研究所，倫敦大學/博士后?
????????????????合作導師：David Barford FRS 英國皇家學會院士????
l? 2008-2012??? ?癌癥研究所，倫敦大學/博士?????
????????????????指導導師：Edward Morris and David Barford
l? 2002-2006?? ??清華大學生物科學與技術系/學士?
????????????????指導導師:饒子和院士
真核生物染色質的結構與功能受到眾多表觀調控因子在時間與空間水平上的精準調控，從而確保生命活動的有序進行。DNA組蛋白和核小體的分子結構與組成形式是造成染色質動態(tài)結構變化的基礎，并與其他表觀因子如組蛋白變體、組蛋白伴侶、組蛋白修飾酶和染色質重塑復合物等一起調控染色質的動態(tài)變化和功能。針對這一重要生命過程，課題組主要從以下幾個方向展開研究工作：
1. 重要表觀遺傳調控相關復合體的功能和分子機制
染色質的表觀遺傳調控由相應的大分子復合物來完成，想要充分闡明表觀遺傳信息是如何被呈現(xiàn)和維持的，就必須對這些調控復合物有分子水平上的理解。課題組通過生物化學和冷凍電鏡等手段，對乙?；头核鼗嚓P的表觀復合物開展功能和結構研究，揭示其發(fā)揮生理功能的分子構架特征。這些復合物往往與腫瘤等重要疾病發(fā)生密切相關，我們希望能進一步在分子水平上理解其參與腫瘤發(fā)生發(fā)展的致病機理，并以此鑒定出創(chuàng)新性藥物靶標蛋白。
2.染色質動態(tài)的原位研究
常染色質和異染色質的動態(tài)變化是細胞命運轉換的關鍵，但是這一變化的具體分子過程和調控機制還有很多未知之處。課題組致力于在細胞核內原位環(huán)境中，在傳統(tǒng)細胞生物學研究的基礎上，結合轉錄組、蛋白質組等組學手段和超分辨結構光成像、冷凍電子斷層成像等成像手段，全面揭示多種表觀因子與染色質的相互作用網(wǎng)絡，從而在多尺度上描繪這些表觀因子所主導的染色質動態(tài)變化的分子景觀藍圖。
3. 基于人工智能的冷凍電鏡研究
課題組致力于通過AI算法的開發(fā)與應用，一方面旨在提升Cryo-EM實驗流程的自動化程度和數(shù)據(jù)收集效率；另一方面，則聚焦于對海量成像數(shù)據(jù)進行深度挖掘與分析，以期揭示更為精細、全面的生物分子結構與功能信息，從而為表觀遺傳調控及染色質動態(tài)學的深入研究提供強有力的技術支持與數(shù)據(jù)洞察。
主要學術成果：
何俊博士，現(xiàn)任中國科學院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院研究員、博士生導師，入選中科院高層次人才項目，并兼任中國生物物理協(xié)會冷凍電子顯微學分會委員、中國電子顯微鏡學會廣東省分會委員。主要專注于利用冷凍電鏡等手段研究生物大分子的高分辨率三維結構特征，探索在生理和病理過程中起到重要作用的表觀遺傳調控機器的結構和分子機理。以第一作者和通訊作者身份在Cell Research、Molecular Cell、Nature Microbiology和 Nature Communication等國際高影響期刊上發(fā)表論文數(shù)十篇，多次受邀在國內外會議上作學術報告。同時承擔國家重點研發(fā)計劃項目、國家自然科學基金國際(地區(qū))合作與交流項目、國家自然科學基金專項項目、國家自然科學基金面上項目、廣東省自然科學基金面上項目等多個科研任務。
中國生物物理學會冷凍電子顯微學分會 委員
中國電子顯微鏡學會廣東省分會 委員中國生物物理學會冷凍電子顯微學分會 理事
2013 Chairman’s Prize for Best PhD, the Institute of Cancer Research
2012 Chinese Government Award for outstanding students abroad
1.Li, W. #, Cao, P. #, Xu, P., Sun, F., Wang, C., Zhang, J., Dong, S., Wilson, J. R., Xu, D., Fan, H., Feng, Z., Zhang, X., Zhu, Q., Fan, Y., Brown, N., Justin, N., Gamblin, S. J., Li, H., Zhang, Y.*, He, J*. Rapid reconstitution of ubiquitinated nucleosome using a non-denatured histone octamer ubiquitylation approach. Cell & Bioscience, 14(1), 81. (2024)
2.Zhang, J. #, Zhao, H., Zou, B., Li, H., Dong, S., Guan, J., Wang, C., Li, W., Liu, Y., Chen, Y., Rasheed, N.*, He, J*. Cryo-EM structure and functional analysis of the chromatin remodeler RSF. Acta Crystallographica Section F: Structural Biology Communications, 80: 125-34. (2024)
3.Xue, L. #, Chang, T. #, Li, Z., Wang, C., Zhao, H., Li, M., Tang, P., Wen, X., Yu, M., Wu, J., Bao, X., Wang, X., Gong, P., He, J., Chen, X.*, Xiong, X*. Cryo-EM structures of Thogoto virus polymerase reveal unique RNA 2 transcription and replication mechanisms among orthomyxoviruses. Nature Communications 15.1 : 4620. (2024)
4.Wang, N. #, Sheng, Y. #, Liu, Y., Guo, Y., He, J., Liu, J*. Cryo-EM structures of Mycobacterium tuberculosis polynucleotide phosphorylase suggest a potential mechanism for its RNA substrate degradation. Archives of Biochemistry and Biophysics, 754, 109917. (2024)
5.Liu, B. #, Niu, X. #, Deng, Y. #, Zhang, Z. #, Wang, Y., Gao, X., Liang, H., Li, Z., Wang, Q., Cheng, Y., Chen, Q., Huang, S., Pan, Y., Su, M., Lin, X., Niu, C., Chen, Y., Yang, W., Zhang, Y., Yan, Q., He, J., Zhao, J.*, Chen, L.*, Xiong, X*. An unconventional VH1-2 antibody tolerates escape mutations and shows an antigenic hotspot on SARS-CoV-2 spike. Cell reports, 43(6), 114265. (2024)
6. Dong, S. #, Li, H. #, Wang, M. #, Rasheed, N. #, Zou, B., Gao, X., Guan, J., Li, W., Zhang, J., Wang, C., Zhou, N., Shi, X., Li, M., Zhou, M., Huang, J., Li, H., Zhang, Y., Wong, K.H., Zhang, X., Chao, W.C.H.*, and He, J*. Structural basis of nucleosome deacetylation and DNA linker tightening by Rpd3S histone deacetylase complex. Cell Research 33, 790-801. (2023)
7. Zhang, X. #, Li, Z. #, Zhang, Y. #, Liu, Y. #, Wang, J., Liu, B., Chen, Q., Wang, Q., Fu, L., Wang, P., Zhong, X., Jin, L., Yan, Q., Chen, L., He, J.*, Zhao, J. *, and Xiong, X*. Disulfide stabilization reveals conserved dynamic features between SARS-CoV-1 and SARS-CoV-2 spikes. Life Science Alliance6. (2023)
8. Yu, H. #, Liu, B. #, Zhang, Y. #, Gao, X. #, Wang, Q. #, Xiang, H. #, Peng, X. #, Xie, C. #, Wang, Y. #, Hu, P., Shi, J., Shi, Q., Zheng, P., Feng, C., Tang, G., Liu, X., Guo, L., Lin, X., Li, J., Liu, C., Huang, Y., Yang, N., Chen, Q., Li, Z., Su, M., Yan, Q., Pei, R., Chen, X., Liu, L., Hu, F., Liang, D., Ke, B., Ke, C. *, Li, F. *, He, J. *, Wang, M.*, Chen, L.*, Xiong, X.*, and Tang, X*. Somatically hypermutated antibodies isolated from SARS-CoV-2 Delta infected patients cross-neutralize heterologous variants. Nature Communications 14, 1058. (2023)
9.Zhang, X.#, Xin, J.#, Wang, Z.#, Wu, W., Liu, Y., Min, Z., Xin, Y., Liu, B., He, J., Zhang, X., and Xu, X*. Structural basis of a bi-functional malonyl-CoA reductase (MCR) from the photosynthetic green non-sulfur bacterium Roseiflexus castenholzii. Mbio14, e0323322. (2023)
10. Tang, L. #, Dong, S. #, Rasheed, N. #, Wu, H.W. #, Zhou, N. #, Li, H., Wang, M., Zheng, J.*, He, J.*, and Chao, W.C.H*. Vibrio parahaemolyticus prey targeting requires autoproteolysis-triggered dimerization of the type VI secretion system effector RhsP. Cell Reports 41, 111732. (2022)
11. He, P. #, Liu, B. #, Gao, X. #, Yan, Q. #, Pei, R. #, Sun, J., Chen, Q., Hou, R., Li, Z., Zhang, Y., Zhao, J., Sun, H., Feng, B., Wang, Q., Yi, H., Hu, P., Li, P., Zhang, Y., Chen, Z., Niu, X., Zhong, X., Jin, L., Liu, X., Qu, K., Ciazynska, K.A., Carter, A.P., Briggs, J.A.G., Chen, J., Liu, J., Chen, X.*, He, J.*, Chen, L.*, and Xiong, X*. SARS-CoV-2 Delta and Omicron variants evade population antibody response by mutations in a single spike epitope. Nature Microbiology 7, 1635-1649. (2022)
12. Chen, M. #, He, Y. #, Liu, D., Tian, L., Xu, P., Liu, X., Pan, Y., Dong, S., He, J. *, and Zhang, Y*. Structure Insights Into Photosystem I Octamer From Cyanobacteria. Frontiers in Microbiology 13, 876122. (2022)
13. Wang, X. et al. A potent human monoclonal antibody with pan-neutralizing activities directly dislocates S trimer of SARS-CoV-2 through binding both up and down forms of RBD. Signal Transduction and Targeted Therapy 7, 114. (2022)
14. Qu, K. #, Chen, Q., Ciazynska, K.A., Liu, B., Zhang, X., Wang, J., He, Y., Guan, J., He, J., Liu, T., Zhang, X., Carter, A.P., Xiong, X.*, and Briggs, J.A.G*. Engineered disulfide reveals structural dynamics of locked SARS-CoV-2 spike. PLoS Pathogens 18, e1010583. (2022)
15. Chen, M. #, Liu, X., He, Y., Li, N., He, J.*, and Zhang, Y*. Diversity Among Cyanobacterial Photosystem I Oligomers. Frontiers in Microbiology 12, 781826. (2021)
16. Zhang, C. #, Li, L., He, J., Chen, C., and Su, D*. Nonstructural protein 7 and 8 complexes of SARS-CoV-2. Protein Science 30, 873-881. (2021)
17. Zhang, C. #, Chen, Y., Li, L., Yang, Y., He, J., Chen, C. *, and Su, D*. Structural basis for the multimerization of nonstructural protein nsp9 from SARS-CoV-2. Molecular biomedicine 1, 5. (2020)
18. Frigola, J. #, He, J. #, Kinkelin, K., Pye, V.E., Renault, L., Douglas, M.E., Remus, D., Cherepanov, P. *, Costa, A. *, and Diffley, J.F.X*. Cdt1 stabilizes an open MCM ring for helicase loading. Nature communications 8, 15720. (2017)
19. He, J. #, Chao, W.C. #, Zhang, Z., Yang, J., Cronin, N., and Barford, D*. Insights into degron recognition by APC/C coactivators from the structure of an Acm1-Cdh1 complex. Molecular cell 50, 649-660. (2013)
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21. da Fonseca, P.C. #, He, J., and Morris, E.P*. Molecular model of the human 26S proteasome. Molecular cell 46, 54-66. (2012)
發(fā)明專利：
通過設計和改造二硫鍵交聯(lián)位點的SLC膜蛋白復合物的制備方法 何俊，官嘉麗，鄒彬倩 （專利號：ZL 2023 1 1158832.1）
軟件著作：
冷凍電鏡前期數(shù)據(jù)質控軟件（cryoPurifier） （軟件著作登記號：2024SR0491806 ）
學生獲獎情況：
2021級
董淑琦（博士生） 榮獲中國科學院院長獎優(yōu)秀獎（2024年）、國家獎學金（2023年）、中國科學院大學優(yōu)秀畢業(yè)生（2024年）、北京市優(yōu)秀畢業(yè)生（2024年）、三好學生（2023年）、GIBH優(yōu)秀研究生獎學金一等獎（2024年）
2022級
官嘉麗（博士生）? 榮獲三好學生（2024年）、三等獎學金（2024年）
趙河豫（博士生）? 榮獲三好學生（2024年）
蘇小鳳（碩士生）? 榮獲三好學生（2024年）
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