2018年博士畢業(yè)于華中農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)微生物國家重點實驗室，同年入選第三屆中國博士后創(chuàng)新人才支持計劃。2022年完成國家重點實驗室博士后工作，入職上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院，擔(dān)任副研究員、課題組長（PI）。2025年3月加入中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院，擔(dān)任譜系技術(shù)與裝備研究中心基因組多維技術(shù)研究組組長（PI）、研究員。
1）主要研究方向：
腫瘤基因組學(xué)、三維基因組學(xué)、基因組結(jié)構(gòu)變異與轉(zhuǎn)錄調(diào)控、單細(xì)胞基因多維組學(xué)技術(shù)開發(fā)。
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2）課題組簡介：
課題組近年來一直圍繞基因組學(xué)進(jìn)行新技術(shù)開發(fā)、基礎(chǔ)研究、應(yīng)用轉(zhuǎn)化工作，開發(fā)了一批具有自主知識產(chǎn)權(quán)的多維染色質(zhì)構(gòu)象及結(jié)構(gòu)變異捕獲新方法，如針對單細(xì)胞的基因組異常與三維結(jié)構(gòu)共檢測技術(shù)Uni-C(Nature Communications，2025，小修修回），專用于腫瘤及遺傳病基因組異常篩查的MGA-Seq（Genome Biology，2023），高通量單細(xì)胞三維結(jié)構(gòu)捕獲技術(shù)sciDLO Hi-C（Nature Communications，2022），以及針對大量細(xì)胞高分辨率三維結(jié)構(gòu)捕獲的DLO Hi-C（Nature Genetics，2018）。這些新方法大幅降低了研究成本，提高了解析精度，其中DLO Hi-C被Nature Genetics專文評述為“優(yōu)雅巧妙的文庫構(gòu)建策略”，并被Nature，Nature Genetics等經(jīng)典期刊廣泛引用。
利用該系列技術(shù)，我們鑒定了腫瘤及遺傳性疾病中多種新型基因組結(jié)構(gòu)變異并進(jìn)行了新抗原預(yù)測，繪制了染色體外DNA（Extrachromosomal DNA,ecDNA）空間調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，解析了免疫細(xì)胞發(fā)育及感染免疫過程中的染色質(zhì)重塑與表觀修飾重編程，提出了染色質(zhì)有序性的概念，并結(jié)合GWAS（Genome-Wide Association Studies）數(shù)據(jù)拓展了感染性疾病易感基因，挖掘了新的治療靶點和藥物。
1）?國家自然科學(xué)基金委員會,面上項目,32370685,基于腫瘤基因組三維結(jié)構(gòu)特征開發(fā)群體及單細(xì)胞ecDNA檢測方法并探究其突變規(guī)律及調(diào)控機(jī)制,2024-01-01 至 2027-12-31,50萬元,在研,主持
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2）?國家自然科學(xué)基金委員會,青年科學(xué)基金項目,31900432,開發(fā)單細(xì)胞DLO Hi-C技術(shù)并解析衰老過程中海馬-內(nèi)嗅皮層神經(jīng)環(huán)路基因組三維構(gòu)象動態(tài)變化,2020-01-01 至 2022-12-31,25萬元,結(jié)題,主持
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3）?人力資源和社會保障部、全國博士后管委會,博士后創(chuàng)新人才支持計劃,BX20180113,利用單細(xì)胞DLO Hi-C技術(shù)解析結(jié)核分枝桿菌潛伏感染后宿主基因組表觀修飾的變化及挖掘結(jié)核易感基因,2018-10 至 2020-09,60萬元,結(jié)題,主持
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4）?中國博士后科學(xué)基金會,面上項目（一等）,2018M640710,結(jié)核分枝桿菌感染誘發(fā)宿主基因組表觀修飾變化的研究,2019-01 至 2020-12,8萬元,結(jié)題,主持
1)?Da Lin#*;Yanyan Zou#;Xinyu Li;Jinyue Wang;Qin Xiao;Xiaochen Gao;Fei Lin;Ningyuan Zhang;Ming Jiao;Yu Guo;Zhaowei Teng;Shiyi Li;Yongchang Wei;Fuling Zhou;Rong Yin;Siheng Zhang;Lingyu Xing;Weize Xu;Xiaofeng Wu;Bing Yang;Ke Xiao;Chengchao Wu;Yingfeng Tao;Xiaoqing Yang;Jing Zhang;Sheng Hu;Shuang Dong;Xiaoyu Li;Shengwei Ye;Zhidan Hong;Yihang Pan;Yuqin Yang;Haixiang Sun*;Gang Cao*;MGA-seq: robust identification of extrachromosomal DNA and genetic variants using multiple genetic abnormality sequencing,Genome Biology,2023,24(1)
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2)?Da Lin#;Weize Xu#;Ping Hong#;Chengchao Wu;Zhihui Zhang;Siheng Zhang;Lingyu Xing;Bing Yang;Wei Zhou;Qin Xiao;Jinyue Wang;Cong Wang;Yu He;Xi Chen;Xiaojian Cao;Jiangwei Man;Aikebaier Reheman;Xiaofeng Wu;Xingjie Hao;Zhe Hu;Chunli Chen;Zimeng Cao;Rong Yin;Zhen F. Fu;Rong Zhou;Zhaowei Teng;Guoliang Li*;Gang Cao*;Decoding the spatial chromatin organization and dynamic epigenetic landscapes of macrophage cells during differentiation and immune activation,Nature Communications,2022,13(1):5857
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3)?Da Lin#;Ping Hong#;Siheng Zhang;Weize Xu;Muhammad Jamal;Keji Yan;Yingying Lei;Liang Li;Yijun Ruan;Zhen F. Fu;Guoliang Li*;Gang Cao*;Digestion-ligation-only Hi-C is an efficient and cost-effective method for chromosome conformation capture,Nature Genetics,2018,50(5):754-763?(亮點文章，Nature genetics同期評論文章專題報道)
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4)?Xiaochen Gao#;Xinyu Li#;Weize Xu;Ming Jiao;Yu Guo;Jiajia Wang;Weihao Wang;Jiling Feng;Qianqian Guo;Chengchao Wu;Taiyu Zhang;Yuqin Yang*;Da Lin*;Identification of multiple genomic alterations and prediction of neoantigens from circulating tumor cells at the single-cell level,Nature Communications,2025?(小修修回)
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5)?Zhihui Zhang#;Chengchao Wu;Khaista Rahman;Weize Xu;Guoliang Li*;Da Lin*;Gang Cao*;Robust capturing chromosome conformation using the DLO Hi-C 2.0 method,Journal of Genetics and Genomics,2020,47(10):655-658
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6)?Da Lin;Siheng Zhang;Zhihui Zhang;Weize Xu;Ping Hong;Guoliang Li;Gang Cao;The?“toolbox” for chromatin conformation capture,SCIENTIA SINICA Vitae,2020,50(5):497-505
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7)?Jun Min#;Da Lin#;Qingye Zhang;Jibing Zhang;Ziniu Yu;Structure-based virtual screening of novel inhibitors of the uridyltransferase activity of Xanthomonas oryzae pv. oryzae GlmU,European Journal of Medicinal Chemistry,2012,53: 150-158
